超级T细胞创新肿瘤免疫治疗

近年来，肿瘤免疫学的研究结果表明，人体自身免疫系统在抗肿瘤的过程起到十分关键的作用。免疫检查点抑制剂具有阻断肿瘤逃避免疫系统杀伤的作用，从而达到抗肿瘤的效果。对部分患者来说，免疫检查点抑制剂疗效十分显著；但有一部分患者，可能因缺乏特定癌症的“路标”，药物疗效不甚理想。

“路标”是肿瘤细胞内因突变而产生的肿瘤特异性抗原，只在肿瘤细胞中表达，是T细胞识别癌细胞的的理想靶点，可激发强烈的抗肿瘤免疫反应。BBLSA公司试图为“路标”应用于临床寻找到可行的方案。

目前新生抗原“路标”鉴定主要有三种常用方法：

方法A：通过WES鉴定肿瘤特异性突变，通过RNA测序确认，然后根据预测突变后的多肽与自体HLA亲和力高低进行分级; 最后，基于优先突变的等位基因合成新肽，然后离体进行T细胞反应性分析以确认它们的免疫原性。

方法B：基于WES鉴定的肿瘤特异性突变，合成TMG构建体作为产生IVT RNA的模板，然后离体进行T细胞反应性分析确认它们的免疫原性。

方法C：基于数据库和文献的研究鉴定突变。接下来的步骤可以与上述两种方法中的任何一种相同。

目前，鉴定高质量新生抗原“路标”国际上目前有三大突破方向：（1）综合考虑表达，克隆，MHC的亲和力，TCR的亲和力等信息给潜在的新生抗原进行打分排序；（2）提高MHC II型识别的新生抗原的预测准确性；（3）预测融合基因或病毒整合来源的新生抗原。

不管是鉴定肿瘤新生抗原的负荷，还是筛选新生抗原作为细胞治疗或肿瘤免疫治疗的靶点，二代测序结合生物信息技术都能够精准高效的实现，是普遍采用的方法。另外，更重要的是也有(河北湖南)团队应用最先进的高分辨率串联质谱技术以及由各种算法预测的肽的生物信息学技术分析鉴定并合成新生抗原(已经开展临床研究，取得非常满意的疗效），尽管这种方法将高度依赖于可用的肿瘤样本的量和MS技术的灵敏度。

大部分的新生抗原鉴定团队都可以做到利用公共软件筛选出MHC分子具有高亲和力的新生抗原，但是如何筛选高质量的新生抗原作为疫苗或细胞治疗的靶点这才是关键。仅仅利用MHC亲和力筛选新生抗原的效率比较低。因为从突变到新生抗原在细胞内部会经过很复杂的过程（从DNA→RNA→蛋白翻译→蛋白降解→TAP转运→抗原呈递→膜上表达→MHC识别等），而肽段与MHC的识别仅仅是其中一个步骤。因此需要综合考虑表达、克隆、MHC的亲和力、TCR的亲和力等等的信息，给新生抗原进行打分排序。国际上每个团队都有自己特异的打分排序算法，例如已经发表的3篇黑色素瘤的个性化疫苗的研究，每个团队都依靠自己的打分排序算法筛选出优质的新生抗原。

TSELA（Tumor Epitope SeLection Alliance，国际新生抗原筛查联盟），是由美国国家癌症中心（CRI）和帕克癌症免疫治疗研究所（PICI）联合纪念斯隆凯特琳癌症中心（MSKCC）、MD安德森癌症中心等30多家新生抗原研究的顶级机构组成，旨在建立全球新生抗原检测的算法和标准，协力预测更精准的抗癌靶点，推进“个性化肿瘤疫苗”的研究和应用。深圳裕策生物高质量新生抗原检测能力得到了国际顶尖机构的认可。

为了将新生抗原假说转化到临床，科学家们正在开发新生抗原疫苗，以激活识别、杀伤肿瘤的T细胞。而且，由于细胞和基因工程的进步，也可以制作特异性识别新生抗原的工程T细胞。开发启动免疫系统的疫苗和细胞疗法是一个诱人的想法，但药物开发的任何新途径都是难以驾驭的。将理想变为现实，这意味着开发治疗方法的公司必须通过三个基础步骤取得进展：

第一步：选择：决定哪种新生抗原最有效。

第二步：启动：一旦新生抗原被识别，选择注射疫苗的理想方式来激发T细胞反应。可以考虑跳过疫苗，直接设计一种新的特异性识别、新生抗原的T细胞。

第三步：治疗策略：设计这些新生抗原疗法如何与其他IO药物结合。

第一种策略是一种疫苗方法，将一组T细胞暴露于特定的新生抗原中，使其处于最佳状态，并扩展相应的T细胞。湖南团队CTC，PDX获得的新生抗原筛选相应的T细胞。

第二种方法，科学家设计或选择T细胞，使其T细胞受体 (TCR)，能特异性的识别新生抗原。通过疫苗策略，可以通过多种方式制作个性化疫苗：将得到的疫苗注入病人体内，引起T细胞反应。

给患者回输基因模板RNA或DNA疫苗，细胞内的核糖体会自动翻译、产生新生抗原本身，或者在类似的体内抗原产生策略中，注入工程化的细菌产生抗原。用病毒感染癌细胞，将新生抗原溶解并扩散到环境中。考虑到研制疫苗的复杂性和不确定性，一些研究小组只是从免疫系统的末端开始，专注于创造大量可会输给患者的、高质量的、特异性识别新生抗原的T细胞。此研究思路有两种实现方式：

1)肿瘤浸润淋巴细胞(TIL)回输，2)工程T细胞受体(TCR)回输。

鉴定哪种新生抗原最有效是整个过程中最重要的环节，因为如果没有明确区分自身肿瘤的新生抗原，T细胞将无法识别和杀伤肿瘤，就无法实现下一步的治疗。对于许多研究者来说，首先对肿瘤组织进行排序，以确定是否有一种“通用”的新生抗原可用。携带特定通用新生抗原的肿瘤患者，可以研制出一种现成的疫苗，并应用于多个患者。Medp ips技术可以期待。对于没有通用新生抗原的患者，疫苗需要根据他们的肿瘤量身定做。一旦选择了新生抗原，下一步就是启动或者如何使用新生抗原激活特异性的T细胞，并诱导机体的免疫系统产生一系列特异性识别肿瘤细胞的毒性T细胞。

参考文献

1.   Chu Y, Liu Q, Wei J, Liu B.Personalized cancer neoantigen vaccines come of age. Theranostics 2018; 8(15):4238-4246.doi:10.7150/thno.24387.

2.   Neoantigen-based cancer immunotherapy:One step closer to the promise of personalized medicine JUNE 2018 /// CONTRIBUTING AUTHORS Peter Bak, PhD Jonathan Barry, MD Michelle Hoffmann, PhD Brendan Wang Stephanie Kwei, MD